繼發性癲癇治療最佳方法為手術治療，藥物治療效果較差，如皮質發育不良性癲癇，藥物治療效果幾乎為零。比較嚴重的結節性硬化或腫瘤、海綿狀血管瘤繼發性癲癇，服藥效果均較差，最有效治療即為對因治療，治療前需檢查明確，原發病與繼發性癲癇是否存在因果關系，一旦確診，則對因手術治療效果顯著，如海綿狀血管瘤發生于左側大腦半球，發作癥狀以左側癥狀為主，可肯定癲癇與海綿狀血管瘤相關，可進行相關手術治療。