男性在射精時尿道疼痛不一定存在炎癥，但炎癥屬于較常見的原因。由于存在炎癥時，患者局部感覺可能處于較敏感的狀態，局部黏膜可能會發生破壞而導致神經裸露。此時患者會喪失正常感覺，出現敏感、異?；蛲从X放大的情況。但有時射精時尿道疼痛，可能僅屬于神經性放射痛、局部神經性或肌肉痙攣性疼痛。在射精時，男性的尿道、射精管及前列腺周圍的肌肉均處于較為敏感、興奮的狀態，若此時肌肉發生痙攣性改變，也會導致男性的尿道或尿道周圍出現痙攣性疼痛。