腫瘤標志物可用于結直腸癌的初篩檢查，結直腸癌相對較特異的標記物主要包括CEA即癌胚抗原、CA199、CA242。腫瘤標記物的檢測，通常不會單純檢查一個指標，而是兩個、三個甚至多個指標聯合檢測，通過整體的變化情況判斷腫瘤發生的可能。現在有一些新的腫瘤標記物已研發出，如HSP即熱休克蛋白，對結直腸癌的診斷有較好的指導意義，但并非所有醫院都可進行檢查。