胸腺瘤的預后與它的分期有關。A型胸腺瘤經手術切除干凈后，一般復發率較低，預后較好；AB型或B型胸腺瘤，已不是單純的良性腫瘤，常處于良惡性的交界，或已經有惡性的情況，患者手術之后還需做進一步的放療和化療，預后較好，多數患者均可活到五年以上；C型的胸腺瘤比較傾向于癌，預后差，會出現惡病質改變，發生胸腺瘤的并發癥，如重癥肌無力等。