如果在疾病早期疾病較輕，或者能夠較好的介入康復治療，大部分腦卒中患者能夠不遺留后遺癥，甚至恢復自理能力，重返工作崗位，但仍然有部分患者會遺留后遺癥。常見后遺癥有肢體癱瘓，即偏癱，以及失語、構音障礙、大小便功能障礙、認知功能障礙、心理障礙等。 對于后遺癥期的患者，康復的方法不同，通常不是以恢復功能為主，而是以提高自理能力為。如患者是左側偏癱，但右側肢體健全，主要以訓練健側肢體的代償能力為主，從而提高患者的生活自理能力，盡可能減少家人的照顧，減輕家庭的負擔。