磁共振可以發現體內生理與生物上較早期的變化，這是其最大優勢，所以磁共振對病變敏感性較高，發現病變準確率較高。訓練有素的醫生通過不同技術幾乎百分百可發現病變。 因磁共振信號產生的理論基礎較復雜，存在不同醫生對信號理解不同，得出結論稍有差別的情況，此為其劣勢。磁共振在醫學領域應用時間相對較短，需加強臨床應用經驗的總結利于提高診斷準確性。