因為磁共振可能對體內磁場進行暫時重新排序，造成胚胎或胎兒早期流產，所以三個月內孕婦嚴禁磁共振檢查。若三個月之后孕婦需要進行磁共振檢查，應對患者進行檢查相關情況的充分告知。若孕婦患其他疾病，應先治療疾病，若只考慮保胎兒，對胎兒并不一定是最好選擇。進行磁共振檢查前，醫生應與患者溝通交流，交代注意事項及風險，使患者自己選擇檢查是否進行。