連花清瘟膠囊與板藍根的區別體現在以下幾個方面：1、藥物組成：板藍根單純為一味中藥，而連花清瘟膠囊為一種中成藥，由金銀花、連翹、麻黃、石膏、杏仁、魚腥草、藿香等藥物組成；2、藥物功效：板藍根具有清熱解毒的功效，而連花清瘟膠囊具有清溫解毒、宣肺泄熱的作用；3、主治疾病：板藍根可以用于治療體內存在內熱、火毒引起的表現，比如咽痛、口舌生瘡、咳嗽、咳黃痰等癥狀，主要用于治療體內存在火熱之邪侵犯人體引起的癥狀。而連花清瘟膠囊除治療體內存在火熱引起的癥狀外，同時還對于各種風熱、病毒性感冒具有較佳的治療作用，包括鼻塞、流黃鼻涕、咳嗽、咳黃痰、發熱、惡寒等癥狀。