單純依靠肝功能檢查指標無法診斷肝癌，肝功能是反映肝臟合成能力、膽汁代謝能力，以及肝實質損害程度的檢測指標。很多因素可造成肝功能異常，如長期大量飲酒造成的酒精性肝損害，或藥物性肝損害、嚴重脂肪肝硬變均可產生肝功能損害，表現為肝功能指標異常。肝癌患者肝功能也會受損，需要結合肝臟功能影像檢查，以及甲胎蛋白、腫瘤免疫指標進行綜合評判。