育齡婦女在懷孕過程中發現的結核病稱為妊娠結核病，因胎兒會加重母體負擔，抗結核藥物可能有至畸作用，故妊娠合并結核病治療起來是較為困難。如果三個月以內的妊娠合并結核病，患者病情比較嚴重，建議母親進行流產處理；而懷孕三個月以上的患者可使用一線抗結核藥物進行治療，但這一類的藥物可以少量通過胎盤，在胎兒的體內有少量的蓄積，存在一定致畸風險。