低溫等離子消融術的危害主要由于醫生經驗不足或溫度參數控制較差引起。如果病變靠近重要血管，可能引起血管損傷，甚至大出血；靠近空腔臟器，可能引起消化道穿孔；靠近膽道，可能損傷膽道引起膽瘺，靠近皮膚。 如果消融溫度參數控制較差，可導致皮膚冷凍傷，出現一系列并發癥，因此建議患者就醫時多和主治醫生交流，制定個體化方案，根據病情選擇不同治療手段。