腭裂手術較常見的基礎方式是兩瓣法。兩瓣法在雙側腭部、牙齦邊緣切開，剖開裂隙，分離腭大神經血管束，使雙側硬腭瓣、軟腭無張力對合，之后進行鼻腔黏膜層、肌肉層和口腔黏膜層的縫合。另外，也可采用反向雙Z法、單瓣法進行手術。通常情況下，完全性腭裂，即從牙槽突開裂至懸雍垂，選擇兩瓣法。不完全性腭裂，尤其是軟腭裂，可選擇反向雙Z或單瓣法。