結核性腹膜炎，如果引起急性腹腔炎癥及腹腔膿腫，甚至誘發持續高熱，通過抗感染治療效果較差，或者合并有腹腔大量膿腫形成，壓迫腸管，此種情況需要通過手術治療。對于多數患者只要正常抗結核治療即可，另外需要日常高能量營養支持，及足夠的熱量供應，以促進腸道功能恢復。后期腸結核或結核性腹膜炎治療，時間至少需要一年以上，需要患者付出更多自律性和耐心，對于合并有結核性腹膜炎，甚至腸結核、腸系膜淋巴結核的患者，在飲食上需以高蛋白、高熱量及半流質食物為主。