腦梗塞靜脈溶栓常使用阿替普酶，目前認為其屬于腦梗塞治療的特效藥。臨床證實此藥能夠切實改善患者預后和殘障程度，對于改善疾病預后是非常重要的藥物，但多數患者到達醫院時已經超過靜脈溶栓的時間窗，如存在動脈取栓條件，也為不錯的治療方案。此外，二級預防用藥，包括抗血小板藥、他汀類調脂藥物，以及心源性腦梗塞所用的抗凝藥，均為腦梗塞患者的有效治療藥物。