懷疑腦炎時，應進行腰穿檢查，抽取腦脊液化驗，再給予正確的診斷。但在腰穿之前，可先進行CT檢查，以排查是否有顱內出血、腦水腫、腦部占位等病變，以保證腰穿檢查的順利進行。 如果已出現以上病變，應根據實際情況，考慮是否需要腰穿檢查。腦炎常有一定的發展過程，在治療后還要給予核磁檢查，以便更清晰地了解腦部病情變化，發現CT不能發現的病變。