首先要明確雌激素水平低是處于一種生理性的低水平現象，還是雌激素的缺乏。正常的生育期女性在月經前后雌激素的低水平現象，是一種正常的低水平狀態，是不需要添加雌激素的。如果是各種疾病，如內分泌疾病、排卵障礙、遺傳性疾病以及圍絕經期綜合征造成的雌激素缺乏，對身體健康造成一定的影響，這時可以在醫生指導下來進行藥物治療。藥物的治療當中，重要的是激素的補充，常用的是雌激素，可以單一用藥或者與孕激素聯合用藥。在此類激素添加之前，需要在醫生指導下進行禁忌癥的排除，包括已知或者可疑的惡性腫瘤，乳腺癌、子宮內膜癌，嚴重的肝腎功能損害，以及血栓性疾病等。這些情況不適合進行雌激素類藥物的添加。此外還可以根據雌激素缺乏的不同癥狀進行其他治療，比如用一些改善睡眠的藥物來促進睡眠，補充鈣劑來預防骨質疏松、骨折、骨痛的發生。此外，心理治療也是提高患者生活質量的一個非常重要的方面。