新型冠狀病毒肺炎傳染源為感染者和無癥狀攜帶者，無癥狀攜帶者即隱性感染者，無表現癥狀，但其病毒載量較高，具有傳染性。病毒中間宿主或自然宿主還未明確，目前認為最大可能是存在于蝙蝠身上，目前已在很多蝙蝠身上發現了與新型冠狀病毒基因相近的冠狀病毒，但并非完全相似。可能還存在中間宿主，如穿山甲、烏龜、蛇等，但均未得到確認，尚未發現哪種動物身上攜帶的病毒和新型冠狀病毒完全一致，即真正的中間宿主還未找到。 疫情最早的傳染源僅為推測，不一定是在武漢的華南海鮮市場，甚至不一定是在武漢，不一定是中國，可能還有其它起源地。