肛瘺手術主要包括肛瘺切除、肛瘺掛線手術和一些新的方法，都是把肛瘺的死腔變為新鮮創面，促進機體生長。早期我們希望長肉芽，肉芽可以慢慢讓死腔變平，不會有竇道或死腔，不會出現復發。但肛瘺手術后期如出現陳舊壞死肉芽，特別是肉芽的創面高出皮膚，會影響肛門傷口的愈合。所以如果術后一段時間出現高出皮膚的肉芽，需要把肉芽組織清除，清除很容易，用鉗子把肉芽組織夾掉，不需要麻醉。只要創面低于切口的平面，皮膚能爬過去，傷口就可以進一步生長，但如果不處理傷口會很難完全愈合。