乙肝小三陽是機體被病毒感染后的狀態，有多種情況。一種情況是小三陽患者幾乎檢測不到病毒復制，這種情況稱為非活動性表面抗原攜帶者，通常患者肝功能正常，病毒檢測陰性，病情較輕微。 另一種情況是患者已出現病毒變異，即小三陽肝炎，病毒檢測陽性，肝功能不正常，此時需要按照普通慢性乙型肝炎進行治療。 乙肝小三陽患者因長時間感染，病毒易出現變異，出現e抗原陰性的乙型肝炎。肝癌或者肝硬化患者通常是乙肝小三陽患者，因感染時間較長，進入肝硬化、肝癌階段，因此乙肝小三陽并不表示病情比較輕。