兒童牙床腫痛主要是口腔厭氧菌感染，所以一般應用針對厭氧菌較有效的抗菌素，最常見的是紅霉素類，首先選擇紅霉素、克林霉素，對厭氧菌有效。 此外，可選擇對厭氧菌有特效的滅滴靈、替硝唑等硝唑類藥，對厭氧菌效果較好。因為抗菌素是處方用藥，所以應就診醫院開處方，醫生會根據病情選擇藥物。 兒童出現牙床腫痛應就診正規醫院選擇口腔科醫生，由口腔科醫生檢查后開具抗菌素，切勿自行購買藥物。