高強度聚焦超聲在局部可以產生一個非常好的治療效果。同樣如果不小心或者準備不充分的情況下，可能會有一些副作用。它是一個把超聲能量聚焦產生熱量來殺滅腫瘤，燒死腫瘤的設備或者是裝置。當然如果靶點偏移了，就像打槍一樣，靶點偏移，或者是準備不足，可能會起到一些因為熱導致的副作用，比方皮膚灼傷，如果處理不好，胃腸道準備不充分，可能造成局部的腸黏膜損害，甚至穿孔，當然這種情況發生率非常低。如果在治療前進行很好的皮膚準備，在治療前進行很好的腸道準備，在治療前進行精準的定位，這些副反應都是可以避免的。這也是要求臨床操作的醫生，或者臨床操作的醫護人員，包括患者，都應該正視，在得到很好的治療同時，最大可能的避免發生副反應。