超聲所使用的造影劑都屬于微氣泡造影劑，一般30分鐘左右造影劑就可以通過肺部呼吸排出體外，副作用很小。自從開展超聲造影檢查以來，接受超聲造影檢查的患者每年近2000余人，尚未出現超聲造影劑過敏者，在國內外也有相應的其他副作用相關的報道。主要包括頭痛、惡心，注射部位疼痛以及感覺異常等，發生率也很低約1%-5%左右。這些不良反應均為暫時性的，反應程度輕微，尚不需要特殊處理，消退后通常無后遺癥。