脊髓栓系綜合征術后并發癥較多，主要包括：1、神經功能障礙加重，比如在做手術過程中損傷脊髓、神經，做完手術立刻就出現原有癥狀加重，或者病人之前沒有癥狀，術后出現新的癥狀，比如雙下肢活動較差、感覺較差，甚至出現雙下肢癱瘓，還有大便無法控制、排便困難、排尿困難、急性尿潴留、尿失禁等，這是手術時間損傷神經和脊髓的癥狀；2、術后有可能出現傷口愈合不良，有的需要重新做手術，有的出現反復感染，反復換藥，抗感染治療的同時在1-2個月之內會逐漸愈合；3、傷口腦脊液漏，所有的脊髓手術在術中，硬脊膜可能縫合不嚴密，腦脊液有可能流出來，流到皮下，甚至從傷口流出來，這種情況需反復穿刺、包扎，甚至還要重新進行手術修補；4、極少數的情況下可能會引起腦積水，術后腦積水往往很兇險，嚴重時需要做腦室引流，甚至腦積水的手術，但引起腦積水的概率較低。