女性患有腎盂腎炎，常用的藥物如下：1、抗生素：常用抗生素包括青霉素類，如阿莫西林、阿莫西林克拉維酸鉀等，以及頭孢類藥物，如二代、三代頭孢中的頭孢呋辛、頭孢克肟等，以及喹諾酮類藥物，如左氧氟沙星、莫西沙星等，如果患者出現腎功能減退，需要減少用藥劑量；2、免疫制劑：腎盂腎炎患者通常存在易感因素，如糖尿病、腎臟病，需要長期應用免疫制劑，產生要嚴格控制的患者血糖，使用免疫抑制劑時可以適當調整劑量；3、改善癥狀的藥物：腎盂腎炎患者可能伴有水腫、高血壓、腎功能衰竭等合并癥，可以對癥應用利尿劑、降壓藥，以及改善貧血的藥物，如促紅細胞生成素、鐵劑等。女性腎盂腎炎患者需要注意抗生素、合并癥、易感因素等方面，需選擇綜合的藥物治療。