限于目前醫學技術發展水平，其冰凍切片檢查診斷準確率有限，一般在95%左右。因冰凍切片檢查一般需半小時內出結果，時間較短，取材未能較充分，制片質量不如常規染色好，供病理醫師診斷思考時間也較有限，因此可能會出現漏診、誤診或未能明確診斷的情況。所有做過術中快速病理檢查的標本，均需進行常規石蠟切片再次檢查診斷，一般以常規石蠟切片診斷為準。 冰凍切片檢查是指手術中的快速病理檢查，冰凍切片即病理醫生拿到標本后，取成小組織塊，放到冰凍制片機里，在-20℃左右冰凍制作的媒介物上進行冷凍，做成切片供病理醫生檢查。但此切片與常規染色切片較朦朧，即有點霧里看花的感覺，因此觀察效果不如常規染色好。