肺移植手術是公認的最難的器官移植手術之一，甚至可以不用質疑。首先從解剖結構上，做肺移植需要連接動脈、靜脈，跟其它臟器移植一樣，而肺移植還需要連接氣管。肺是人體最基本的生命功能器官，腎臟、肝臟可以喪失一部分功能，但是肺不行，特別是雙側肺移植的病人，一旦失敗，搶救的余地都沒有，因為基本的生命功能都沒有了。即使肺移植成功，術后病人必須保持低免疫狀態，因為要降低自身對移植肺的排斥作用，所以要一直口服抗免疫藥物。肺作為直接接觸外界空氣的重要器官，會接觸到很多細菌、很多外界灰塵，肺免疫力降低，術后并發癥相對其它器官移植手術多很多，而且很多情況下，并發癥來勢洶洶，病人甚至來不及反應，會給病人生命造成很大威脅。