DPP-4抑制劑主要的副作用，其實是指上呼吸道的感染，包括鼻竇炎、鼻炎，還有牙齦感染，主要集中在上呼吸道，包括中耳炎，風險確實比其他的高，但是不會致命。另外的副作用可能是皮膚皮疹，包括過敏。相比而言，可能因為大多數藥物可能是胃腸反應，但是DPP-4抑制劑，可能是皮膚病變、皮疹、過敏、上呼吸道感染，這種比例相對會比較高。另外一部分的不良反應或者副作用主要集中在頭痛，有些人可能會出現頭痛。所以基本上都是集中在上呼吸道、頭部的不良反應，和其他胃腸不良反應不同。可能有些人會出現轉氨酶升高，這個比例相對不是很高，因為這類藥主要作用在腸道，就是抑制血中的GLP-1的代謝，抑制、破壞酶的活性。因為GLP-1主要是作用在腸道，所以有些患者，如果本身有胰腺炎或者胰腺的病變，這類藥物不推薦使用。所以DPP-4抑制劑的主要的副作用，是上呼吸道的感染，如鼻竇炎、鼻炎、中耳炎，以及牙齦炎。另外就是皮疹或者皮炎、頭痛，還有肝區不適，或者轉氨酶升高。另外有一部分，如果有胰腺炎，不推薦再使用。