多器官衰竭的病因目前來說還不是非常明確，醫學上是也是沒有完全闡明。多器官功能衰竭現在認為是一個自我的完全失控的破壞性的炎癥綜合的反應，因為多器官損傷雖然是繼發于創傷、感染之后，但是它的發病的原因不一定跟原發的部位有關系，比如說病人是存在感染。但是多器官損傷的部位往往會遠離這個感染的位置，比如說你肺部的感染，可能會存在膿毒癥腦病，也可能損傷到腎，我們叫急性腎損傷，也可能影響到肝。所以說多臟器衰竭它的發病原因，現在就是說不一定跟它的外源性的因素，或者是它的感染性的因素有一定的關系。它往往跟外源性的因素無關，這就提示了可能跟內源性的因素有非常的大的關系，現在的臨床研究實驗室檢查，提示可能會跟幾個因素相關： 1、細胞因子過量或者是腸道的菌素移位，將腸黏膜的屏障破壞； 2、內毒素的損傷，有很大的相互作用的關系，而往往這些因素它不是獨立的，往往這些因素它是相關的，互相促進的，比如說感染內毒素損傷導致酸中毒、休克，然后酸中毒又引起代謝功能的衰竭、內環境紊亂，導致休克進一步加重，又加重了代酸或者是乳酸酸中毒，所以這一類的內環境的紊亂，它又進一步破壞你的循環。所以就是說它是一個相互作用的鏈條，綜合作用因素導致的一個多臟器衰竭的結果。