慢性咽炎多數的情況下是由于急性咽炎控制的不是特別好，遷延成慢性的咽炎。還有咽部鄰近器官的炎癥導致慢性咽炎。比如鼻炎、鼻竇炎，分泌物從鼻腔后端流入到咽部，反復刺激，造成慢性咽炎。還有扁桃體炎癥，反復發炎導致了咽部的炎癥。胃部的反流性疾病，胃酸少量的反到咽喉，造成咽部的反復不適。 所以慢性咽炎通常首先要甄別是咽部本身的慢性炎癥，咽部局部的原因，還是鄰近器官發炎造成。如果是鄰近器官炎癥或者疾病造成咽炎，將鄰近器官的炎癥治療控制，慢性咽炎就可得到徹底的根治。