新生兒肛周膿腫的治療分兩期： 1、早期：膿腫較小，或者膿腫還沒有形成，僅是局部的小范圍感染時，建議馬上通過抗生素、抗炎的藥物來進行保守處理，但是，強調的是要足療程、規范化抗感染治療； 2、加重期：感染持續加重，已經形成膿腫，需要聯合小兒外科進行切開引流，把膿液或者是瘺管處理。引流需要在膿腫內填塞紗條，保持引流通暢，是減少肛周膿腫復發或者肛瘺形成的關鍵。而且術后，要加強肛周皮膚的護理，盡量減少皮膚皮損、減少膿腫再發。一旦出現這種情況，是因為皮膚的護理不到位，出院前還要進行家屬的皮膚護理的宣教、教育。