畸形精子癥并不代表一定不會懷孕。按照第五版教材，畸形精子癥是指精液中正常形態的精子少于4%，而畸形精子超過95%。畸形精子是指精子頭、體、尾的形態變異，可能存在精子遺傳物質缺失或者異常。畸形精子過多會影響正常受精，與男性生育率呈負相關性。引起畸形精子癥的原因有泌尿生殖道感染、腮腺炎合并的睪丸炎、附睪結核、精索靜脈曲張等，均可影響精子質量。使用激素或某些化學藥物，如抗癌藥物利血平、馬利蘭、呋喃類藥物等，可使精子發育不成熟。生殖腺受到放射線照射，可引起精子突變；陰囊局部長期高熱，長期酗酒均可使精子發生畸變。如果男性精子的畸形率不是太高，在男性生育的正常范圍中，不會影響生育。如果男性精子的畸形率比較高，能夠正常受精的精子比較少，就會影響生育。