畸形精子癥患者可能使配偶懷孕，但畸形精子不能使配偶懷孕。男性每次排精約排出幾千萬到3億的精子，多數精子為不成熟狀態，所以可能表現為各種畸形。臨床判斷生育能力，主要是根據正常精子比例，依據WHO(世界衛生組織)第五版標準，正常精子達4%時可維持正常生育能力。如果畸形精子癥患者正常形態精子小于4%時，會影響受孕能力，但并不影響優生優育，因為任何畸形精子都不會造成女性自然懷孕。部分精子運動能力較差時，可通過人工授精的方式使女性受孕。