牙齦增生的手術本身無風險，凡是手術，一定要考慮到全身因素的風險，比如血壓、血糖、心臟等問題，如果有高血壓、糖尿病，都存在著一些手術風險，這是通用的手術風險，不是單指牙齦手術的風險。凡是手術一般都需要麻醉，就有麻醉風險的存在，包括麻藥過敏或者麻藥引起其它反應。所以牙齦手術的風險，主要為全身疾病的風險，牙齦增生手術無大的風險。手術設計也要考慮到對于牙齦的形態，包括牙齦的角化齦的寬度等，要達到比較好的設計，切除的牙齦要保留足夠的附著齦寬度，對預后較好，可防止牙齦退縮，防止出現的風險，其它基本沒有風險。