子宮內膜異位癥，因為對大部分病人引起明顯疼痛而造成非常大的困擾，臨床治療以緩解疼痛為主要目的。西醫對疼痛的治療主要是口服止痛藥或者打止痛針。但在中醫方面對藥的治療也非常有效。平時所說的逐瘀湯汁這類的藥物都可以用來治療子宮內膜異位癥。還有外敷中藥包等溫通藥物，對子宮內膜異位癥的治療都有非常好的效果。除此以外，還有灌腸，像莪棱灌腸液，這些活血化瘀的藥液的灌注，可以對盆腔環境達到緩解疼痛目的。除此以外，如果子宮內膜異位癥遷延到卵巢，形成卵巢囊腫，包塊＞5cm以上建議手術治療。如果包塊沒有達到5cm建議定期復查。若子宮包塊卵巢的子宮內膜異位癥有5cm以上，可以首選腹腔鏡微創手術治療。