骨肉瘤術后軟組織感染復發問題，其實是一般感染，沒有特殊，按一般的感染處理即可。如果波及骨質，就按骨髓炎治療。如果做的異體半關節置換或異體骨移植，感染的部位出現骨髓炎相應癥狀，要徹底治愈就要按骨髓炎治療。這種情況不會是單純的軟組織感染，一般是深部的骨質出現問題。如果植入有其它異性材料，可能需手術清除，把骨感染及軟組織感染治愈后，再考慮局部缺損修復。部分特殊治療案例顯示，骨肉瘤術后感染對骨肉瘤復發率的降低，可能還有一定作用，但僅限于經驗。