肛門有點疼的常見原因如下：一、痔瘡：1、血栓性外痔：即外痔出現血栓；2、外痔：當外痔出現炎癥反應，如炎性外痔，可能會引起疼痛；3、內痔脫出：如果脫出不能還納，會出現血液循環障礙，痔體出現充血、水腫、表面糜爛，會引起嚴重的疼痛感；4、內痔：可能內痔會出現炎癥反應，也會有相對較輕的疼痛，以及肛門不適感。二、肛裂：典型的肛裂疼痛比常見痔瘡疼痛更嚴重，與痔瘡疼痛有明顯區別，肛裂疼痛呈現周期性疼痛，在排便時肛門會出現抽搐樣疼痛，便后緩解1-2分鐘會再次出現更加強烈的疼痛，持續時間不定，可能是幾分鐘或者幾小時，甚至1天，可能會影響到患者工作、生活。三、肛周膿腫：肛周膿腫會出現持續性疼痛，隨著時間延長，可能會越來越嚴重。肛周膿腫是在肛周旁邊會出現紅、腫、熱、痛的包塊，個別肛周膿腫可能肛門外觀沒有表現，而通過肛門直腸指診可能會出現隆起包塊，即可確診。四、盆底痛：找不到原因的肛門疼痛稱為盆底痛，可能是由于許多原因引起，因為不能夠明確其原因，所以需要進行詳細地系統化檢查，才能予以確診。