低位直腸癌保肛手術的并發癥，主要有以下幾個：第一、最常見的并發癥就是直腸前切除綜合征，這種綜合征是由于直腸切除以后，原來新建的直腸的順應性減低，當結腸內的糞便排到直腸的時候，會因刺激引起黃色性的排便，所以會導致排便頻繁，同時可以引起肛門墜脹感；第二、最嚴重的并發癥就是吻合口瘺，吻合口長不好，糞便通過這個口漏到腹腔引起并發癥；第三、手術以后的出血，包括腹腔出血、吻合口出血；第四、腹腔感染、切口感染；第五、性功能障礙，因為手術過程中，需要切除生殖系統的一些神經末梢，而且損傷到該神經末梢會導致手術以后性功能障礙，尤其是對于男性，可能會更為明顯；第六、排尿功能障礙，因為同樣的植物神經系統，在手術過程中多多少少會損傷到植物神經系統，會導致排尿功能障礙；第七、腫瘤的復發，對于一些中晚期的病人，術后復發也是并發癥之一。除此之外，還有一些手術有并發癥，包括腸梗阻、腸粘連等其他并發癥。