纖維支氣管鏡檢查禁忌癥主要考慮有大咯血、嚴重心肺功能失常、合并急性心肌梗塞、嚴重呼吸困難。纖支鏡檢查的禁忌癥是相對的，沒有絕對禁忌癥，包括大咯血和嚴重心肺功能衰竭，通過氣管插管搶救之后，如果有需要，仍然可以在床旁進行纖支鏡檢查。而且纖支鏡檢查能夠在鏡下止血，另外纖支鏡檢查能夠明確出血原因和部位，更有利于局部止血治療。纖支鏡檢查還有禁忌癥就是患者極度不配合，但是這可以通過對患者耐心教育，或者給患者講授纖支鏡檢查的必要性和相關方面知識，讓患者接受。