顱內感染有輕、有重，治療的條件不同，自身的合并癥、并發癥和抵抗力不同，其治療的時間亦不確定。輕型的病毒性腦炎，其損害不大，很多患者幾天至十幾天可治療好；中、重型的顱內感染，可導致腦損害，其治療時間相對較長。此外，顱內感染的治療時間亦與病原菌有關，如結核的抗感染治療，需一年甚至更長的時間才可治愈。所以，顱內感染多久能治好，其時間可以很短，亦可以很長，部分患者可能無法治愈，導致嚴重的后遺癥甚至死亡。