煙霧病搭橋手術本身的后遺癥的發生幾率，相對來說是比較低的，和其他的開顱手術的后遺癥大致是相同的，只不過是搭橋術后有的病人因為再灌注有再出血的可能。但是臨床當中，在手術之后要通過嚴密的控制病人的血壓，這種并發癥相對來說發生的幾率比較低。對于其他的并發癥就像和普通的開顱手術一樣，因此也沒有太多的相對于搭橋手術本身的并發癥。另外，也有一部分病人因為在煙霧病的搭橋手術，特別是手術當中，如果血壓過低，也可能造成搭橋手術對側的大腦會出現缺血性的改變。這是手術當中應該盡量預防，在手術當中也和麻醉盡量的合作，把病人的血壓不要降得太低，盡量保持病人腦氧的正常和血壓的正常。