肝臟是直腸間質瘤最常見的轉移部位，如果患者在發病過程中出現消瘦、乏力、肝區不適甚至肝區疼痛或者黃疸，這時候應當想到直腸間質瘤出現肝臟轉移可能性。通常可以簡單采用超聲或者肝臟CT、核磁來檢查是否出現肝臟轉移，而且其最好的檢測手段就是肝臟核磁。而從臨床經驗來看，肝臟核磁相對于PET-CT來說，檢測肝轉移的敏感度會更高。對于出現肝轉移后應當根據腫瘤轉移部位以及大小來明確是否有根治性切除的可能性。