直腸間質瘤能治愈，但是每個人的情況不同，因為每個人的危險程度不同，直腸間質瘤的特點也不一樣，其治療效果可能也會不同，而且基因型、基因突變位點不一樣，也直接決定了其愈后。甚至部分直腸間質瘤的患者，腫瘤的位置非常低，還牽扯到可是否能保肛的問題。但是經過新輔助的治療，比如之前成功的一個病例，就是經過新輔助的治療，使腫瘤的直徑縮小2cm之后，把括約肌閃開，就可以做局部地切除，不僅把直腸間質瘤切掉，同時還可以有效地保留了直腸括約肌，也就是俗稱的保肛。把肛門保留完整之后，生活質量明顯好得多。否則要做直腸會陰的聯合切除，這樣對生活質量有相當大的影響。直腸間質瘤的治療，也是按照間質瘤的治療的規范進行，也是通過手術結合靶向藥物的治療。但因為直腸的間質瘤的位置相對特殊，所以其在治療上有部分自身的特點。