牙周手術一般是在基礎治療2-3個月后，然后再進行口腔狀況全面的檢查，包括一些牙周袋X線來進行全面的評估，如果仍不能達到非常好的愈合狀況，那么就可以考慮牙周手術。牙周的基礎治療包括全口的潔治和齦下的刮治，這兩個做完以后，一般齦上和齦下大多數的局部刺激物基本上就被去除了，這時2-3個月以后，如果牙周袋的深度依然≥5mm，還有比如有骨下袋、牙槽骨的外形不規則，這些情況都可以進行牙周的手術；還有一些比如根分叉的病變，都可以通過牙周手術來降低它的高度，使牙周容易清潔。