一般妊娠合并甲亢，常首選的藥物有兩種，第一種是丙基硫氧嘧啶，這種藥在早期或者備孕期使用，其實用在國內達到了共識，每天用100-150mg治療。長期使用要監測肝腎功能，該藥物的代謝對肝腎功能有毒性作用，但它對胎兒的致畸作用還未有過很多報道。孕后期、晚期或者哺乳期，需改成甲巰咪唑，甲巰咪唑它對肝腎功能的損傷相對較小，因為胎盤已經形成后，受胎盤屏障保護，孩子受影響較小，所以后期可改為甲巰咪唑治療。治療甲亢這兩種藥物目前還是首選考慮。但若希望在孕期把甲亢癥狀，甲亢生化指標控制的較好，則需要調整用藥劑量。