引起兒童腦神經損傷的病因較多，與母親妊娠、分娩過程及生產后疾病等多個環節的高危因素有關，這些高危因素會導致胎兒或新生兒腦損傷，腦發育異常。總體而言，兒童腦神經損傷的病因包括產前、圍生期和產后因素。產前因素包括妊娠早期母親的先兆流產、宮內感染，妊娠中晚期胎兒宮內窘迫，母親低血糖、高血壓、糖尿病、多胎妊娠以及遺傳因素中染色體病、先天性代謝缺陷，還有一些臨床常見的綜合征等。圍生期因素包括早產、低出生體重、過期產、巨大兒、新生兒窒息、新生兒缺氧缺血性腦病、顱內出血、新生兒中樞神經系統感染、低血糖、膽紅素腦病以及羊水、臍帶、胎盤異常等。產后因素包括驚厥、各種感染、顱內出血、腦外傷等。