兒童腦神經損傷的原因分為以下三個方面：1、缺氧：包括宮內缺氧和生后缺氧，缺氧后引起腦細胞壞死，造成腦實質性損害，出現運動和智力落后或障礙；2、細菌或者病毒感染引起的腦神經損傷：細菌或是病毒侵襲大腦神經系統造成腦細胞死亡，使受感染的腦神經細胞功能喪失，造成腦神經損傷，如宮內感染、乙腦、流腦等；3、外傷或手術引起的意外事故造成的腦損傷：如手術切除大腦功能區的病灶后，術中出血、壓迫或功能區受損造成的腦神經損傷，或是外傷引起的大腦出血、腦震蕩造成的病理性改變。以上都是造成腦神經損傷的原因，因此腦神經損傷應該針對病因做針對性的治療，才能得到事半功倍的效果。