男人陰莖出現小紅疙瘩的主要原因有以下幾種：1、普通炎癥：陰莖皮膚上存在皮脂腺，皮脂腺易引起感染，細菌進入皮脂腺內或皮脂腺內的分泌物造成皮脂腺體堵塞，此時細菌繁殖，就會導致毛囊炎，形成毛囊炎后，會出現小紅疙瘩，此時會出現疼痛、發癢等一系列感覺；2、性傳播疾病：常見的是尖銳濕疣，尖銳濕疣的典型表現為菜花狀腫物，尖銳濕疣在剛出現還比較小的時候，看起來類似小紅疙瘩，此時若不能進行鑒別，需要進一步觀察，或前往皮膚性病專科就診。