有些患者往往術后擔心射頻消融手術會不會伴有疼痛，疼痛與我們機體的多種因素有關，包括個體差異、個體敏感性、消融部位、消融深度和時間，還有消融范圍等。一般來說在射頻消融過程中，都會采用局部麻醉將導管送至心內，進行相應病灶的消融。普通患者一般不會感覺到疼，但是有一些特殊患者比較敏感，有可能會感到疼。射頻消融整個過程對于陣發性室上性心動過速而言，大約為1-2分鐘，患者可能疼了幾十秒。比如房顫消融的患者，多會采用靜脈鎮痛的措施，疼痛可能不會太明顯，絕大多數患者都能耐受整個手術過程，僅有一小部分患者可能是因為緊張或者疼痛比較厲害，可以輔助部分鎮靜的藥物來避免。由于疼痛而不能耐受手術的情況很少出現。