微波治療一般選擇20-60W，以患者局部有溫熱感即可，要防止灼傷即防止燙傷。該治療可以使患處血管擴張，血液循環加速，改善局部營養供給。一般結合中藥局部外用，可以增加中藥滲透性，局部藥物濃度可以大大提高，增加療效。往往作為以手術為主的綜合治療一部分，一般很少單獨應用微波來進行治療骨髓炎。該治療方法屬于手術前、手術后用來增加局部血液循環，可以起到一定的輔助作用，部分醫院經常采用可見光治療或磁熱等方法來進行替代。