長節段骨缺損在臨床上相對比較常見，通常是由創傷、感染、腫瘤以及各種先天性疾病所導致。如今由于高能量創傷所導致長節段骨缺損比較多見，如車禍、在礦場礦石砸傷、機器碾壓傷等，嚴重創傷當時就可以造成長節段骨缺損。嚴重的開放性粉碎性骨折，若手術后感染，在清創時不得不把粉碎性骨折塊清除掉，清除掉之后就會形成長節段骨缺損。感染尤其是血源性感染，往往膿液擴散會造成長段骨頭感染，對感染進行治療的過程中清除感染灶可以造成長節段骨缺損。骨的惡性腫瘤清理不干凈術后非常容易復發，所以一般情況下要求廣泛切除，容易造成長節段骨缺損。先天性疾病即比較常見的如脛骨假關節，脛骨假關節屬于先天性疾病，骨頭強度本身比較差，比較輕微的外力甚至沒有外力就造成骨折，在骨折附近骨質條件很差，如果按一般骨折單純復位固定很難愈合，所以一般要把病變骨徹底清除掉，會形成長節段骨缺損。